Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW29

RWDD4, RWD domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD4Q6NW29 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RWDD4Q6NW29 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RWDD4Q6NW29 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms