Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UFSP1Q6NVU6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UFSP1Q6NVU6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms