Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRNP1Q6NT89 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRNP1Q6NT89 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms