Protein–RNA interactions for Protein: Q6IBW4

NCAPH2, Condensin-2 complex subunit H2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPH2Q6IBW4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPH2Q6IBW4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPH2Q6IBW4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPH2Q6IBW4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NCAPH2Q6IBW4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NCAPH2Q6IBW4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms