Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LARP1BQ659C4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LARP1BQ659C4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
LARP1BQ659C4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms