Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0N0

C9orf57, Uncharacterized protein C9orf57, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf57Q5W0N0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C9orf57Q5W0N0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C9orf57Q5W0N0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms