Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
C1orf220Q5T0J3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
C1orf220Q5T0J3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms