Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNT1Q5JUK3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
KCNT1Q5JUK3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms