Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
KHDC3LQ587J8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
KHDC3LQ587J8 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms