Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ACSM3Q53FZ2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms