Protein–RNA interactions for Protein: Q3MHD2

LSM12, Protein LSM12 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSM12Q3MHD2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
LSM12Q3MHD2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms