Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ISXQ2M1V0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ISXQ2M1V0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms