Protein–RNA interactions for Protein: Q29RF7

PDS5A, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5AQ29RF7 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDS5AQ29RF7 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PDS5AQ29RF7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
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