Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GEN1Q17RS7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GEN1Q17RS7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
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