Protein–RNA interactions for Protein: Q16881

TXNRD1, Thioredoxin reductase 1, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNRD1Q16881 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TXNRD1Q16881 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TXNRD1Q16881 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
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