Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDK4Q16654 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDK4Q16654 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms