Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NTRK3Q16288 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NTRK3Q16288 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
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