Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNCBQ16143 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SNCBQ16143 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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