Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CNN3Q15417 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms