Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAM2Q15035 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAM2Q15035 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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