Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SHPRHQ149N8 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SHPRHQ149N8 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
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