Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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IRF3Q14653 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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IRF3Q14653 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
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IRF3Q14653 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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IRF3Q14653 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
IRF3Q14653 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
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IRF3Q14653 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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IRF3Q14653 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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IRF3Q14653 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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IRF3Q14653 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
IRF3Q14653 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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