Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
RBM39Q14498 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
RBM39Q14498 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms