Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCARF1Q14162 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCARF1Q14162 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
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