Protein–RNA interactions for Protein: Q14088

RAB33A, Ras-related protein Rab-33A, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB33AQ14088 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RAB33AQ14088 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB33AQ14088 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB33AQ14088 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms