Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CKAP5Q14008 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
CKAP5Q14008 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms