Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PDE6HQ13956 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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PDE6HQ13956 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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PDE6HQ13956 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PDE6HQ13956 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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