Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TUBA3CQ13748 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
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TUBA3CQ13748 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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TUBA3CQ13748 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TUBA3CQ13748 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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