Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MTMR3Q13615 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MTMR3Q13615 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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