Protein–RNA interactions for Protein: Q13610

PWP1, Periodic tryptophan protein 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PWP1Q13610 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PWP1Q13610 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PWP1Q13610 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms