Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRR1Q13601 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRR1Q13601 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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