Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTM1Q13496 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTM1Q13496 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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