Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
SGCGQ13326 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SGCGQ13326 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
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