Protein–RNA interactions for Protein: Q13233

MAP3K1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K1Q13233 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
MAP3K1Q13233 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
MAP3K1Q13233 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms