Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CBX3Q13185 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CBX3Q13185 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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