Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 EXOC4-204ENST00000460346 762 ntTSL 49.11□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TRAPPC9-210ENST00000521667 2021 ntTSL 1 (best)17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TRAPPC9-208ENST00000520857 3693 ntTSL 1 (best)12.3□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TRAPPC9-202ENST00000438773 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.642e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-206ENST00000457404 778 ntTSL 221.17■□□□□ 0.982e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-212ENST00000504028 596 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-215ENST00000508518 677 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-217ENST00000509426 1356 ntTSL 218.05■□□□□ 0.482e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-216ENST00000509031 1177 ntTSL 1 (best)17.71■□□□□ 0.432e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-218ENST00000510015 582 ntTSL 517.68■□□□□ 0.422e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-221ENST00000514209 481 ntTSL 517.42■□□□□ 0.382e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.342e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.122e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-203ENST00000351450 1072 ntTSL 215.05■□□□□ -02e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.162e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-210ENST00000502833 842 ntTSL 312.69□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-214ENST00000506815 839 ntTSL 29.5□□□□□ -0.892e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-211ENST00000503171 585 ntTSL 47.52□□□□□ -1.212e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PPA2-222ENST00000515567 368 ntTSL 56.12□□□□□ -1.432e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.234e-17■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 NEAT1-204ENST00000612303 572 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.434e-17■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 GRB10-221ENST00000483819 657 ntTSL 221.96■■□□□ 1.114e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 GRB10-220ENST00000483157 540 ntTSL 413.16□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 GRB10-216ENST00000470992 544 ntTSL 411.78□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 GRB10-223ENST00000492265 447 ntTSL 34.3□□□□□ -1.724e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.152e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 SLC18B1-203ENST00000460518 491 ntTSL 59.71□□□□□ -0.862e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 GATAD2A-212ENST00000494516 640 ntTSL 220.34■□□□□ 0.859e-9■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 GATAD2A-204ENST00000417582 655 ntTSL 219.9■□□□□ 0.789e-9■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 OXSR1-204ENST00000467900 612 ntTSL 55.06□□□□□ -1.62e-18■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 EHMT1-214ENST00000488242 789 ntTSL 513.51□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 EHMT1-213ENST00000486164 781 ntTSL 313.37□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 29.06□□□□□ -0.961e-6■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.46e-14■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.256e-14■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 TUBGCP3-203ENST00000462580 915 ntTSL 35.86□□□□□ -1.476e-14■■■■□ 25.6
TARDBPQ13148 VAPB-204ENST00000475243 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.683e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-207ENST00000470417 1931 ntTSL 323.63■■□□□ 1.371e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.31e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-204ENST00000431732 767 ntTSL 523.11■■□□□ 1.291e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.191e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.91e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-206ENST00000449649 667 ntTSL 516.52■□□□□ 0.241e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-202ENST00000412383 981 ntTSL 316.03■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RALB-205ENST00000447591 558 ntTSL 414.04□□□□□ -0.161e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-205ENST00000535267 579 ntTSL 225.98■■□□□ 1.758e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.688e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-203ENST00000535054 460 ntTSL 325■■□□□ 1.598e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-210ENST00000537947 1100 ntTSL 324.38■■□□□ 1.498e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-216ENST00000542989 839 ntTSL 320.05■□□□□ 0.88e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-223ENST00000497822 542 ntTSL 219.67■□□□□ 0.744e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-220ENST00000489918 427 ntTSL 319.57■□□□□ 0.724e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.728e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-210ENST00000465270 543 ntTSL 219.46■□□□□ 0.714e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-203ENST00000368242 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 318.85■□□□□ 0.614e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.538e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-212ENST00000538437 747 ntTSL 218.34■□□□□ 0.538e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-207ENST00000463309 685 ntTSL 318.19■□□□□ 0.54e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.478e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-219ENST00000489877 536 ntTSL 517.67■□□□□ 0.424e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-216ENST00000484428 578 ntTSL 317.67■□□□□ 0.424e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-208ENST00000464203 766 ntTSL 517.67■□□□□ 0.424e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-206ENST00000536290 438 ntTSL 517.58■□□□□ 0.48e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-214ENST00000539138 511 ntTSL 316.96■□□□□ 0.318e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-215ENST00000482932 826 ntTSL 516.9■□□□□ 0.34e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-217ENST00000486517 726 ntTSL 316.05■□□□□ 0.164e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 STARD10-221ENST00000546314 620 ntTSL 315.99■□□□□ 0.158e-7■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-214ENST00000476966 2697 ntTSL 212.73□□□□□ -0.374e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-213ENST00000471156 764 ntTSL 512.4□□□□□ -0.424e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-204ENST00000368243 879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.684e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-201ENST00000310027 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)8.52□□□□□ -1.054e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-202ENST00000357975 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 37.58□□□□□ -1.24e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-221ENST00000492750 475 ntTSL 57.21□□□□□ -1.264e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-224ENST00000497824 725 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.734e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 C1orf61-205ENST00000400991 473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)3.41□□□□□ -1.864e-15■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RPRD1B-203ENST00000462548 2436 ntTSL 513.78□□□□□ -0.22e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RPRD1B-201ENST00000373433 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.72e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 NAP1L4-202ENST00000399614 594 ntTSL 45.64□□□□□ -1.511e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-212ENST00000563038 2692 ntTSL 1 (best)16.72■□□□□ 0.271e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.191e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.091e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.061e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-218ENST00000566982 3024 ntTSL 214.47□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.21e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.251e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-222ENST00000569340 714 ntTSL 313.22□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-211ENST00000562556 4659 ntTSL 212.84□□□□□ -0.351e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 CPSF6-201ENST00000266679 2229 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 BCAR1-203ENST00000393422 4064 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.481e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.971e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 PILRB-203ENST00000431140 772 ntTSL 313.61□□□□□ -0.237e-42■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RICTOR-206ENST00000510711 3126 ntTSL 29.23□□□□□ -0.933e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RICTOR-209ENST00000514735 686 ntTSL 37.22□□□□□ -1.253e-6■■■■□ 25.5
TARDBPQ13148 RICTOR-208ENST00000513566 1762 ntTSL 1 (best)6.52□□□□□ -1.373e-6■■■■□ 25.5
Retrieved 100 of 14,326 protein–RNA pairs in 430.7 ms