Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
LCP2Q13094 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
LCP2Q13094 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms