Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NFX1Q12986 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
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