Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 SRS2YJL092W 3525 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 ARP7YPR034W 1434 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 RPL6BYLR448W 531 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 RPR1RPR1 369 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 IRC23YOR044W 474 nt4.58□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YDR338CYDR338C 2088 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 ATP17YDR377W 306 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YAL056C-AYAL056C-A 351 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 RPS9AYPL081W 594 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 DAD3YBR233W-A 285 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 snR49snR49 165 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 HOP1YIL072W 1818 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 CEP3YMR168C 1827 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 PCK1YKR097W 1650 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YNL193WYNL193W 1677 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 KRE6YPR159W 2163 nt4.57□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 MBP1YDL056W 2502 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 HAP1YLR256W 4509 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 APL6YGR261C 2430 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YDR187CYDR187C 519 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YGL041CYGL041C 204 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 RPL28YGL103W 450 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 SDH2YLL041C 801 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 SRL1YOR247W 633 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 snR35snR35 204 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 snR48snR48 113 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 TRS65YGR166W 1683 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 ATM1YMR301C 2073 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 HUL4YJR036C 2679 nt4.56□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 SRC1YML034W 2505 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 HXT14YNL318C 1623 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 MVB12YGR206W 306 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 RPA12YJR063W 378 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YLR230WYLR230W 306 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 RPS7BYNL096C 573 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YNL285WYNL285W 372 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YOL155W-AYOL155W-A 135 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 ISU2YOR226C 471 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 STE20YHL007C 2820 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 UTP25YIL091C 2166 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 NUP116YMR047C 3342 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 AVT3YKL146W 2079 nt4.55□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 PCA1YBR295W 3651 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 MDR1YGR100W 2853 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YDR340WYDR340W 303 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 SLX8YER116C 825 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 ECT1YGR007W 972 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 SCW4YGR279C 1161 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YIL012WYIL012W 342 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YIR040CYIR040C 333 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 CWC24YLR323C 780 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YLR458WYLR458W 381 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 URA10YMR271C 684 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 OPY2YPR075C 1083 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YBR238CYBR238C 2196 nt4.54□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 EMI1YDR512C 564 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YHR214C-EYHR214C-E 300 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 IRC18YJL037W 675 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 HSP10YOR020C 321 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 IES4YOR189W 351 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 PIS1YPR113W 663 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YCK2YNL154C 1641 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 YSW1YBR148W 1830 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 SEG2YKL105C 3399 nt4.53□□□□□ -1.68
TY1A-DR3Q12441 PGM2YMR105C 1710 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 TRK2YKR050W 2670 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 GPI10YGL142C 1851 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YLR001CYLR001C 2589 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 TRX3YCR083W 384 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 TIF35YDR429C 825 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 ERG28YER044C 447 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YER066C-AYER066C-A 501 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SCS22YBL091C-A 528 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 MCP1YOR228C 909 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 PRP43YGL120C 2304 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 LAS21YJL062W 2493 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YEL1YBL060W 2064 nt4.52□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 TOS3YGL179C 1683 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SEC39YLR440C 2130 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 VID22YLR373C 2706 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SNA4YDL123W 423 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 RPS5YJR123W 678 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 CIN4YMR138W 576 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YPL039WYPL039W 951 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 VPS9YML097C 1356 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 RIM15YFL033C 5313 nt4.51□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 HOYDL227C 1761 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 ARN2YHL047C 1863 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 EXO70YJL085W 1872 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 PUT2YHR037W 1728 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 RRT13YER066W 558 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 RPS8BYER102W 603 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YFR054CYFR054C 579 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YHR212CYHR212C 336 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 PET191YJR034W 327 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 YAR060CYAR060C 336 nt4.5□□□□□ -1.69
TY1A-DR3Q12441 SAP30YMR263W 606 nt4.5□□□□□ -1.69
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