Protein–RNA interactions for Protein: Q12246

LCB4, Sphingoid long chain base kinase 4, yeastyeast

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Length 624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB4Q12246 SRD1YCR018C 666 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YDR157WYDR157W 402 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 CPR5YDR304C 678 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YER084W-AYER084W-A 513 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YER175W-AYER175W-A 165 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 TDA8YAL064C-A 381 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YLR334CYLR334C 381 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SEN15YMR059W 387 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GOT1YMR292W 417 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YPL261CYPL261C 309 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YPR012WYPR012W 255 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RRG8YPR116W 834 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SPA2YLL021W 4401 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PEX6YNL329C 3093 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PRP22YER013W 3438 nt3.37□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 TGL3YMR313C 1929 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 TAF1YGR274C 3201 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 FLO5YHR211W 3228 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 BRE5YNR051C 1548 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 VPS74YDR372C 1038 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RPL9AYGL147C 576 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 MVB12YGR206W 306 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YLR154W-FYLR154W-F 141 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ATX1YNL259C 222 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 MPD2YOL088C 834 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 FYV12YOR183W 390 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RPB5YBR154C 648 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SEC6YIL068C 2418 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 DAN4YJR151C 3486 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SLM2YNL047C 1971 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 POL4YCR014C 1749 nt3.36□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 CPA2YJR109C 3357 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 VIP1YLR410W 3441 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RIM13YMR154C 2184 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GRX2YDR513W 432 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PUG1YER185W 912 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 MIC19YFR011C 513 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 CDC26YFR036W 375 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RPL11BYGR085C 525 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 COX23YHR116W 456 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YHR130CYHR130C 336 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 TOM22YNL131W 459 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RPL11AYPR102C 525 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PBS2YJL128C 2007 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SHS1YDL225W 1656 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SWC4YGR002C 1431 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 NCS2YNL119W 1482 nt3.35□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SMI1YGR229C 1518 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 UBP16YPL072W 1500 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SEG1YMR086W 2883 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YPS6YIR039C 1614 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 EMC1YCL045C 2283 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 snR59snR59 78 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 MIX14YDR031W 366 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PHM6YDR281C 315 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SMX2YFL017W-A 234 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 COX13YGL191W 390 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YGR039WYGR039W 312 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 RSR1YGR152C 819 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 ANB1YJR047C 474 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SOD1YJR104C 465 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 VPS51YKR020W 495 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 SDO1YLR022C 753 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YLR224WYLR224W 1110 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 PDP3YLR455W 915 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 DYN3YMR299C 939 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 GPI15YNL038W 690 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 LDS2YOL047C 1071 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 YPL088WYPL088W 1029 nt3.34□□□□□ -1.87
LCB4Q12246 AVT5YBL089W 1380 nt3.34□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 MET10YFR030W 3108 nt3.34□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 ARG5,6YER069W 2592 nt3.34□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 ARP4YJL081C 1470 nt3.34□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YBR259WYBR259W 2067 nt3.34□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YDL050CYDL050C 372 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 HNT1YDL125C 477 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 BCD1YHR040W 1101 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YIR020CYIR020C 303 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 ENV10YLR065C 546 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YNL046WYNL046W 519 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YOL114CYOL114C 609 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 IMD4YML056C 1575 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YLR177WYLR177W 1887 nt3.33□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 SHE4YOR035C 2370 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 NSP1YJL041W 2472 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YDR089WYDR089W 2610 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 TIF4631YGR162W 2859 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 ARF1YDL192W 546 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 PPH3YDR075W 927 nt3.32□□□□□ -1.88
LCB4Q12246 YDR114CYDR114C 303 nt3.32□□□□□ -1.88
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