Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 SEC16YPL085W 6588 nt2.12□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SLY41YOR307C 1362 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YDR061WYDR061W 1620 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SNU23YDL098C 585 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YRB1YDR002W 606 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YIL102C-AYIL102C-A 228 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YJR020WYJR020W 333 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YKL070WYKL070W 510 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SRL3YKR091W 741 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YLR163W-AYLR163W-A 114 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 PRM6YML047C 1059 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 RPL25YOL127W 429 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 CBP6YBR120C 489 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YDR131CYDR131C 1671 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 POM152YMR129W 4014 nt2.11□□□□□ -2.07
USB1Q12208 SCD5YOR329C 2619 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 DBF20YPR111W 1695 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 APC11YDL008W 498 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YFH1YDL120W 525 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 AI3Q0060 1248 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YAP5YIR018W 738 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 MET14YKL001C 609 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 LIP2YLR239C 987 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 RPL36BYPL249C-A 303 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 snR43snR43 209 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 KEL2YGR238C 2649 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 VPS13YLL040C 9435 nt2.1□□□□□ -2.07
USB1Q12208 IPI3YNL182C 1668 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 NUP170YBL079W 4509 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 PRE1YER012W 597 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 UPF3YGR072W 1164 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 NOP19YGR251W 591 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 PFS1YHR185C 714 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 YNL046WYNL046W 519 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 PDR17YNL264C 1053 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 TSR4YOL022C 1227 nt2.09□□□□□ -2.07
USB1Q12208 HOP1YIL072W 1818 nt2.09□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YNL018CYNL018C 1839 nt2.09□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YDR186CYDR186C 2634 nt2.09□□□□□ -2.08
USB1Q12208 CDC5YMR001C 2118 nt2.09□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YRR1YOR162C 2433 nt2.09□□□□□ -2.08
USB1Q12208 UBP15YMR304W 3693 nt2.09□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YPK1YKL126W 2043 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 PDS5YMR076C 3834 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SCY1YGL083W 2415 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 DIG2YDR480W 972 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 PET191YJR034W 327 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 BET3YKR068C 582 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 FPR1YNL135C 345 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YOL118CYOL118C 309 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 CRS5YOR031W 210 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YBR292CYBR292C 372 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 PHO91YNR013C 2685 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ROY1YMR258C 1662 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SVL3YPL032C 2478 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YKR078WYKR078W 1758 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SPF1YEL031W 3648 nt2.08□□□□□ -2.08
USB1Q12208 MUB1YMR100W 1863 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YCR064CYCR064C 411 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YDR124WYDR124W 975 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 TIM9YEL020W-A 264 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YGR050CYGR050C 357 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 COG2YGR120C 789 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ALB1YJL122W 528 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SRT1YMR101C 1032 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 DNL4YOR005C 2835 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ARP9YMR033W 1404 nt2.07□□□□□ -2.08
USB1Q12208 RPL13AYDL082W 600 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 HLR1YDR528W 1272 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 TDA10YGR205W 873 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 DSE2YHR143W 978 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YIL156W-BYIL156W-B 222 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YLR257WYLR257W 966 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 PNO1YOR145C 825 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ICS2YBR157C 768 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ARK1YNL020C 1917 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 MDM10YAL010C 1482 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 TOF1YNL273W 3717 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 RPN3YER021W 1572 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 ERT1YBR239C 1590 nt2.06□□□□□ -2.08
USB1Q12208 TMN3YER113C 2121 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 HOS4YIL112W 3252 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 BNI1YNL271C 5862 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YMR099CYMR099C 894 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YMR187CYMR187C 1296 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 RPN8YOR261C 1017 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 RFC5YBR087W 1065 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 YBR209WYBR209W 318 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 STE11YLR362W 2154 nt2.05□□□□□ -2.08
USB1Q12208 VPS41YDR080W 2979 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SSD1YDR293C 3753 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 SLF1YDR515W 1344 nt2.04□□□□□ -2.08
USB1Q12208 APC2YLR127C 2562 nt2.04□□□□□ -2.08
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