Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LMOD3Q0VAK6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LMOD3Q0VAK6 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms