Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RBBP4Q09028 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RBBP4Q09028 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms