Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C2orf54Q08AI8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C2orf54Q08AI8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms