Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DHX9Q08211 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DHX9Q08211 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms