Protein–RNA interactions for Protein: Q05315

CLC, Galectin-10, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCQ05315 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLCQ05315 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLCQ05315 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLCQ05315 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLCQ05315 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CLCQ05315 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLCQ05315 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CLCQ05315 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CLCQ05315 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms