Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ERCC6Q03468 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ERCC6Q03468 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms