Protein–RNA interactions for Protein: Q02127

DHODH, Dihydroorotate dehydrogenase (quinone), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHODHQ02127 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
DHODHQ02127 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
DHODHQ02127 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms