Protein–RNA interactions for Protein: Q01826

SATB1, DNA-binding protein SATB1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB1Q01826 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SATB1Q01826 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SATB1Q01826 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms