Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OTUD4Q01804 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OTUD4Q01804 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms